Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms