Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms