Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20BQ9P0W2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20BQ9P0W2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms