Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GSKIPQ9P0R6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms