Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCMF1Q9P0J7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms