Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms