Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms