Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRMT1Q9NXH9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRMT1Q9NXH9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms