Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFA4L2Q9NRX3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFA4L2Q9NRX3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms