Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPHK2Q9NRA0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms