Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BATF3Q9NR55 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BATF3Q9NR55 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms