Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RTN4Q9NQC3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTN4Q9NQC3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms