Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LHX9Q9NQ69 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms