Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB18Q9NP72 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms