Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PLXNA4Q9HCM2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms