Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHARPINQ9H0F6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms