Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PDGFDQ9GZP0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms