Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms