Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR3CQ9C0K3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms