Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT23Q9C075 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT23Q9C075 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms