Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ROPN1BQ9BZX4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms