Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EDEM3Q9BZQ6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms