Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EBF4Q9BQW3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms