Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL13Q99616 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL13Q99616 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms