Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HHIPQ96QV1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HHIPQ96QV1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms