Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMTK3Q96Q04 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms