Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TSNARE1Q96NA8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms