Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JSRP1Q96MG2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JSRP1Q96MG2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms