Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGD4Q96M96 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGD4Q96M96 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms