Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00615Q96LM1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms