Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED3Q96IU2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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