Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM44Q96DX7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms