Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG4CQ96DT6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG4CQ96DT6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms