Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NXNL1Q96CM4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NXNL1Q96CM4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms