Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMIGD2Q96BF3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD2Q96BF3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms