Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPSB1Q96BD6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms