Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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GTF3C6Q969F1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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