Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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RABGGTAQ92696 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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RABGGTAQ92696 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RABGGTAQ92696 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RABGGTAQ92696 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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RABGGTAQ92696 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RABGGTAQ92696 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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