Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DNAJA4Q8WW22 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms