Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEDD1Q8NHV4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms