Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms