Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMER3Q8N944 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms