Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHCHD4Q8N4Q1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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