Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP3Q8IZU3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYCP3Q8IZU3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP3Q8IZU3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP3Q8IZU3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP3Q8IZU3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SYCP3Q8IZU3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYCP3Q8IZU3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms