Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IFNL1Q8IU54 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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IFNL1Q8IU54 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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IFNL1Q8IU54 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNL1Q8IU54 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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