Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NME9Q86XW9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NME9Q86XW9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms