Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
WDR53Q7Z5U6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms