Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
DHX29Q7Z478 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX29Q7Z478 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms