Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC29A4Q7RTT9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms