Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY3Q7L099 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY3Q7L099 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms